成立于2018年10月的“復(fù)雜體系多尺度研究院(MRICS)”坐落于復(fù)旦大學(xué)張江校區(qū),由上海市“高峰人才計劃”支持。MRICS致力于發(fā)展全新而有效的、貫通微觀分子結(jié)構(gòu)直至宏觀醫(yī)學(xué)成像的多尺度影像分析技術(shù),為解析生命奧秘提供前所未有的、囊括分子-細胞-組織-器官乃至整個生物體的時空影像數(shù)據(jù)。目前MRICS已經(jīng)建成一個最先進的冷凍電鏡平臺,其中包括FEI Titan Krios,Glacios,Talos和Aquilos等。整套設(shè)施于2020年1月1號投入使用。我們的團隊包括諾貝爾獎得主Michael Levitt教授和國際一流交叉學(xué)科專家等。
目前,研究院已擁有國際一流的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測算法開發(fā)平臺和世界領(lǐng)先的冷凍電鏡平臺,不斷發(fā)展全新而有效的、貫通微觀分子結(jié)構(gòu)直至宏觀醫(yī)學(xué)成像的多尺度影像分析技術(shù),為解析生命奧秘提供前所未有的,囊括分子、細胞、組織、器官乃至整個生物體的時空影像數(shù)據(jù)。成立至今,研究院已建設(shè)起具備干濕結(jié)合、基于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的全鏈條AI賦能新藥創(chuàng)新的一體化研發(fā)平臺。
全球領(lǐng)先計算生物學(xué)AI算法開發(fā)平臺
研究院科研團隊自主研發(fā)的蛋白質(zhì)折疊算法和側(cè)鏈建模算法,精度顯著優(yōu)于AlphaFold2,側(cè)鏈更接近天然構(gòu)象;在蛋白質(zhì)突變領(lǐng)域,原創(chuàng)算法可以對點突變可能帶來的生物學(xué)功能變化進行準確預(yù)測。團隊原創(chuàng)的冷凍電鏡解析算法成功補充了冷凍電子顯微鏡(Cryo-EM)結(jié)構(gòu)解析技術(shù)中因傳統(tǒng)方法無法分辨而缺損的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),并高效且精準地分辨出柔性極大的結(jié)構(gòu)區(qū)在蛋白受測樣品中的構(gòu)象分布。原創(chuàng)的分子動力學(xué)模擬增強取樣算法對AlphaFold2預(yù)測結(jié)構(gòu)中的誤差予以修正,在精度上超越專用計算機Anton,達到全球最優(yōu)。
研究院與上海人工智能實驗室共同組建計算生物學(xué)創(chuàng)新中心,以人工智能為技術(shù)中樞,構(gòu)建新一代生物體系分析工具與方法,解讀生物遺傳信息,加速生命科學(xué)在分子層面的研究。通過對蛋白質(zhì)、DNA等分子功能結(jié)構(gòu)的預(yù)測與設(shè)計,打破生物數(shù)據(jù)壁壘,為生命科學(xué)研究提供新的思路與方法。
生物信息學(xué)單細胞測序分析平臺
研究院自主開發(fā)了完整的生物信息學(xué)研究平臺。特別是單細胞大數(shù)據(jù)平臺,團隊基于此不斷挖掘細胞類型和細胞亞群之間的差異,深入探索單細胞水平的基因表達差異并揭示其內(nèi)部復(fù)雜的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),以解析細胞分化、發(fā)育和疾病機制。同時,團隊致力于整合來自基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)等多個組學(xué)的數(shù)據(jù),建立跨層次關(guān)聯(lián)探尋生物學(xué)含義,并結(jié)合機器學(xué)習(xí)、深度學(xué)習(xí)算法,挖掘潛在的基因和蛋白質(zhì)靶標,為疾病診斷和創(chuàng)新藥物開發(fā)提供新的思路和方向。該領(lǐng)域技術(shù)對研究疾病中的細胞命運決定和分子學(xué)基礎(chǔ)至關(guān)重要。
結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究平臺
冷凍電子顯微技術(shù)作為結(jié)構(gòu)生物學(xué)最重要的研究手段之一,在研究蛋白質(zhì)、細胞和組織的結(jié)構(gòu)和功能中起到至關(guān)重要的作用。目前研究院建有各類冷凍電子透射顯微鏡(包括FEI Titan Krios,Glacios,Talos和Aquilos等),以及高性能的計算集群,可以從高分辨率的蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)(分子生物學(xué))和原位環(huán)境下蛋白、細胞組織的空間分布(細胞生物學(xué))等不同尺度來回答前沿的生命科學(xué)問題,研究對象包括蛋白質(zhì)生物大分子、亞細胞器乃至細胞和組織,研究方法包括冷凍電鏡單顆粒技術(shù)、原位電子斷層掃描技術(shù)和原位單顆粒技術(shù)等。
研究院打造了一支跨學(xué)科的國際化研究團隊,其中包括國際頂尖的計算結(jié)構(gòu)生物學(xué)專家、2013年諾貝爾化學(xué)獎得主Michael Levitt教授,2004年Norman Hackermann化學(xué)研究獎獲得者馬劍鵬教授以及來自美國斯坦福大學(xué)、貝勒醫(yī)學(xué)院、萊斯大學(xué)、加州大學(xué)伯克利分校、清華大學(xué)、中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)、中國科學(xué)院大學(xué)等高層次人才及青年研究員。自2018年以來,研究院科研團隊的重要成果相繼發(fā)表在Nature, Science, PNAS, Nucleic Acids Research, Cell Reports等頂級科學(xué)雜志。
招聘方向:
生物學(xué)相關(guān)研究崗(只招聘碩士,要求本科是985)
任職要求:
在國內(nèi)外高校獲得基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、細胞生物學(xué)、腫瘤生物學(xué)等相關(guān)領(lǐng)域碩士學(xué)位,在本領(lǐng)域具有代表性研究成果,并具有良好的團隊協(xié)作精神;
招收方向:
1.掌握流式細胞術(shù)、蛋白純化、細胞培養(yǎng)、PCR、RT-PCR等細胞分子生物學(xué)相關(guān)知識和經(jīng)驗者優(yōu)先;
2.掌握CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)和經(jīng)驗者優(yōu)先;
3.精通動物實驗的操作技術(shù)和經(jīng)驗者優(yōu)先;
4.熟練藥物合成相關(guān)知識和經(jīng)驗者優(yōu)先。
本院優(yōu)勢:
1.依據(jù)科研任務(wù)和學(xué)術(shù)目標,提供充足的經(jīng)費支撐,可持續(xù)追加經(jīng)費支持;
2.提供具有國際競爭力的薪酬,可對標國內(nèi)任何單位能提供的薪酬標準;
3.與上海人工智能實驗室聯(lián)合招募,集聚全球優(yōu)秀人工智能及計算生物學(xué)科研人才。
福利待遇:
一人一議,具體多少需要面試溝通。
提供食堂、宿舍,五險一金繳納的基數(shù)、比例:按事業(yè)單位最高比例交
工作地址:上海浦東新區(qū)張衡路825號
投遞方式:
聯(lián)系人:楊老師 13503077519(微信同號)
郵箱投遞:fddxfztxdcdyjy@163.com,郵件標題注明:應(yīng)聘某某崗位+本人姓名+高校人才網(wǎng)。【快捷投遞:點擊下方“立即投遞/投遞簡歷”,即刻進行職位報名】