1907年，德國(guó)醫(yī)生埃里?！毬≡谏虾?chuàng)辦“德文醫(yī)學(xué)堂”，是同濟(jì)大學(xué)的前身，也是同濟(jì)醫(yī)學(xué)專業(yè)的開(kāi)端。20世紀(jì)50年代，在全國(guó)高等學(xué)校院系布局調(diào)整中，醫(yī)學(xué)院整體遷出至武漢，但同濟(jì)人醫(yī)學(xué)情結(jié)至深，歷經(jīng)百年滄桑后，同濟(jì)大學(xué)在新世紀(jì)之初重建醫(yī)學(xué)。2000年4月，同濟(jì)大學(xué)與原上海鐵道大學(xué)合并，在原上海鐵道大學(xué)醫(yī)學(xué)院的基礎(chǔ)上恢復(fù)設(shè)立了“同濟(jì)大學(xué)醫(yī)學(xué)院”。經(jīng)過(guò)快速發(fā)展，醫(yī)學(xué)學(xué)科的整體水平已躋身全國(guó)醫(yī)學(xué)院校前10%。2022年進(jìn)入教育部直屬優(yōu)質(zhì)醫(yī)學(xué)院校名單（共18所院校入選）。在國(guó)際國(guó)內(nèi)排名方面，QS（Quacquarelli Symonds）排名12，泰晤士高等教育THE排名11。2022年臨床醫(yī)學(xué)學(xué)科進(jìn)入 ESI 世界前 1‰，8個(gè)醫(yī)學(xué)相關(guān)學(xué)科進(jìn)入ESI世界前1% （世界前沿學(xué)科）。臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)和康復(fù)物理治療專業(yè)被列入國(guó)家一流本科專業(yè)建設(shè)點(diǎn)。
    “十四五”期間，新增國(guó)家級(jí)、省部級(jí)科研平臺(tái)7個(gè)，包括心臟病全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，實(shí)現(xiàn)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室零的突破。新增了一批高層次科技創(chuàng)新領(lǐng)軍人才，柔性引進(jìn)中國(guó)科學(xué)院院士1人，新增國(guó)際院士3人（劉中民教授當(dāng)選俄羅斯工程院外籍院士，鄭加麟教授當(dāng)選歐洲科學(xué)與藝術(shù)院院士（醫(yī)學(xué)學(xué)部）和歐洲科學(xué)院院士，孫毅教授當(dāng)選俄羅斯工程院外籍院士），新增長(zhǎng)江學(xué)者2人、杰青6人、優(yōu)青11人。獲批各類科研項(xiàng)目1524項(xiàng)，科研項(xiàng)目立項(xiàng)總經(jīng)費(fèi)達(dá)12.585億元。截至2025年6月底，牽頭承擔(dān)國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃首席項(xiàng)目18項(xiàng)。獲批國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目958項(xiàng)，獲資助直接經(jīng)費(fèi)4.75億元，其中重點(diǎn)重大類項(xiàng)目48項(xiàng)，包括基礎(chǔ)中心項(xiàng)目1項(xiàng)、創(chuàng)新群體2項(xiàng)。作為第一完成單位獲國(guó)家、省部級(jí)科學(xué)技術(shù)獎(jiǎng)8項(xiàng)，包括國(guó)家科技進(jìn)步獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)1項(xiàng)、省部級(jí)科技一等獎(jiǎng)6項(xiàng)、何梁何利獎(jiǎng)1項(xiàng)。發(fā)表頂刊論文Nature 4篇、Cell 4篇、The Lancet 1篇、NEJM 3篇、BMJ 2篇等20分以上高影響力論文242篇。2020年，學(xué)校在復(fù)興同濟(jì)醫(yī)科的道路上做出重大布局，將同濟(jì)大學(xué)滬西校區(qū)400余畝土地劃歸醫(yī)學(xué)發(fā)展使用，促進(jìn)醫(yī)學(xué)院及附屬醫(yī)院在產(chǎn)學(xué)研、醫(yī)教研融合創(chuàng)新發(fā)展。2021年，學(xué)校投入近3億，改造修繕科研實(shí)驗(yàn)室、實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心及生活體育設(shè)施空間2萬(wàn)余平方米。2023年醫(yī)學(xué)院整體搬遷至滬西同濟(jì)醫(yī)學(xué)園區(qū)，未來(lái)滬西將建設(shè)成為在國(guó)際上具有較高影響力的醫(yī)學(xué)教育培訓(xùn)的高地，醫(yī)學(xué)科學(xué)創(chuàng)新的高地，醫(yī)工交叉創(chuàng)新高地，區(qū)域融合產(chǎn)學(xué)研轉(zhuǎn)化高地。同時(shí)，與市區(qū)兩級(jí)政府深入合作，打造“一核、一城、一岸”，即以同濟(jì)大學(xué)醫(yī)學(xué)院為輻射源，打造生命健康策源核，成為國(guó)內(nèi)一流的環(huán)同濟(jì)國(guó)家生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)園區(qū)，并同步帶動(dòng)建設(shè)TOP智創(chuàng)城、蘇河生命水岸，初步形成超百億級(jí)環(huán)同濟(jì)醫(yī)學(xué)園區(qū)經(jīng)濟(jì)圈。