基因組所介紹
中國農業(yè)科學院深圳農業(yè)基因組研究所（簡稱“基因組所”）成立于2014年，由農業(yè)農村部、中國農業(yè)科學院和深圳市政府共同支持建設?；蚪M所通過整合生物學和大數(shù)據(jù)科學，來認識與利用農業(yè)生物基因組，服務全球農業(yè)生產。為此，基因組所成立了組學技術、合成生物學、植物基因組、動物基因組、生態(tài)基因組、食品科學等研究中心和相關技術平臺。基因組所的長期愿景是致力于通過顛覆性創(chuàng)新來促進全球農業(yè)可持續(xù)發(fā)展，服務于個性化食品供給體系，并提升人類健康水平和農民社會地位！成立以來，基因組所深入貫徹落實習近平總書記“四個面向、兩個一流”指示精神，開展科研自主權改革試點工作，被列為中國農科院現(xiàn)代院所改革的“試驗田”，建立了由中國農科院與深圳市主管領導任共同理事長的理事會；組建了近800人的研究隊伍；形成了以組學技術為核心、輻射農業(yè)、食品和生態(tài)方向的學科體系，獲批“嶺南現(xiàn)代農業(yè)科學與技術廣東省實驗室深圳分中心”“農業(yè)農村部農業(yè)基因數(shù)據(jù)分析重點實驗室”等創(chuàng)新載體；在包括 Science、Nature、Cell 等頂級期刊在內的雜志上發(fā)表SCI論文400多篇，以基因組設計育種育成國審、省審新品種30余個，農業(yè)基因組學等研究領域占據(jù)世界前沿。2019年、2020年連續(xù)兩年自然指數(shù)排名全國農業(yè)類科研院所第一名，多項成果入選“‘十三五’農業(yè)科技十大標志性成果”“中國生命科學十大進展”“中國農業(yè)科學十大進展”。先后獲得“何梁何利基金”獎、“周光召基礎科學獎”“深圳經(jīng)濟特區(qū)建立40周年創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)和先進模范人物”“深圳市市長獎”等獎勵。
目前，基因組所聯(lián)合深圳市相關部門提出了“深圳國際食品谷”，規(guī)劃已得到市政府印發(fā)，將構建農業(yè)食品產學研協(xié)作生態(tài)，做出科技推動農業(yè)食品產業(yè)轉型升級的先行示范。
課題組介紹
程時鋒團隊主要從事植物比較進化基因組學、作物群體數(shù)量遺傳學、關鍵性狀遺傳解析及主要麥類、豆類分子遺傳育種等研究工作，發(fā)起和主持全球“谷-豆”基因組國際聯(lián)盟協(xié)助組，并建立了以“小麥”和“豌豆”為標桿的禾本科及豆科模式研究對象。在圍繞“植物是如何獲得新性狀及其遺傳演化分子機制解析”這一科學問題中，從物種水平(Phylogenomics)、群體水平(Population Genetics)以及關鍵表型性狀（如C4高光合、結瘤固氮等）的泛組學等不同時空維度中展開研究工作，建立起了植物基于性狀（trait-based）的進化基因組學研究方法、作物群體基因-性狀（gene-trait）關聯(lián)和連鎖基因發(fā)現(xiàn)和解析體系，并致力于基因組大數(shù)據(jù)指導下的作物品種改良及農業(yè)育種應用。
一、招聘崗位
根據(jù)團隊工作需要，擬招聘：
（一）博士后4名，其中：
1. 比較進化基因組學、生物信息學大數(shù)據(jù)研發(fā)博士后1名
2. 作物群體數(shù)量遺傳學、生物信息學大數(shù)據(jù)研發(fā)博士后1名
3. 生物信息算法開發(fā)博士后1名
4. 關鍵植物性狀(如C3/C4、共生結瘤)實驗進化方面博士后1名
（二）生物信息工程師2名
（三）作物遺傳育種專員2名
二、崗位職責
（一）生物信息工程師
1. 基因組功能元件、序列模型預測深度學習算法、流程開發(fā)。
2. 植物大規(guī)模系統(tǒng)比較進化基因組學大數(shù)據(jù)分析，方法構建。
3. 作物群體基因組學與數(shù)量遺傳學大數(shù)據(jù)分析，及基因發(fā)現(xiàn)方法。
4. 開發(fā)群體基因組大的結構性變異(pan-sv)、泛基因(pan-genome)，以及基于變異矩陣的全基因組關聯(lián)分析（GWAS）方法。
5. 利用深度學習等算法整合基因大數(shù)據(jù)，開發(fā)表征量化可視化方法，開發(fā)數(shù)據(jù)庫，建設網(wǎng)站在線分析工具。
（二）作物遺傳育種專員
1. 作物田間實驗設計、規(guī)劃和管理。
2. 作物表型鑒定、組織/核酸/材料提取等樣本文庫制備。
3. 負責育種基地管理和育種項目實施，包括作物的田間雜交、材料管護、品種選育等育種相關工作。
三、應聘條件
（一）博士后
1. 具有博士學位，數(shù)學、計算機科學、數(shù)理統(tǒng)計、生物信息學、物理學、基因組學等相關專業(yè)。
2. 近3年在國際學術刊物以第一作者發(fā)表過或即將發(fā)表SCI論文。
3. 熟練使用Linux系統(tǒng)，至少熟練掌握Perl、Python、R、C/C++、JAVA等語言中的兩種。
4. 勤于思考，能獨立開展課題研究，學術態(tài)度嚴謹，善于團隊合作。
5. 良好的溝通能力和中英文科研寫作能力。
（二）生物信息工程師
1. 本科及以上學歷，生物信息學或計算機專業(yè)。
2. 熟練使用Linux系統(tǒng)，至少熟練掌握Perl、Python、R、C/C++、JAVA等語言中的兩種。
3. 有相關工作經(jīng)驗者優(yōu)先。
（三）作物遺傳育種專員
1. 本科及以上學歷，育種相關專業(yè)，具有作物（小麥優(yōu)先）育種相關的理論知識。
2. 有一年以上從事作物育種（如作物品種的選育）工作經(jīng)驗優(yōu)先考慮。
3. 具有一定的計算機運用能力，能獨立完成數(shù)據(jù)收集、錄入和分析。
4. 工作認真，有責任感，執(zhí)行力強，工作效率高；具有良好的溝通能力和團隊協(xié)作能力。
5. 英語寫作和口語優(yōu)秀者，優(yōu)先考慮。
四、薪資待遇
（一）博士后
1. 按照深圳市、大鵬新區(qū)相關規(guī)定，博士后在站期間享受在站博士后生活補貼，具體金額以政府最新規(guī)定為準。
2. 按照研究所的相關規(guī)定提供博士后的工資、五險一金和績效待遇。
3. 符合條件的，可申請"博士后創(chuàng)新人才支持計劃"、"博士后國際交流計劃派出項目、引進項目"、廣東省海外博士后人才支持項目、中國農業(yè)科學院博士后"優(yōu)農計劃"，在站期間可申報"中國農業(yè)科學院優(yōu)秀博士后"評審，入選者給予獎金獎勵。
4. 博士后人員進站后，可選擇落戶深圳市，其配偶及未成年子女可辦理隨遷入戶。
5. 符合條件的博士后可申請評定專業(yè)技術資格。
6. 深圳市對出站博士后留深工作、簽訂3年勞動合同的，給予30萬元資助，用于科研投入或創(chuàng)業(yè)前期費用。
7. 提供良好的工作環(huán)境和充足的研究經(jīng)費，配備研究需要的設備和儀器，科研方向給予較高自由度。
（二）生物信息工程師/作物遺傳育種專員
1. 提供具有市場競爭力的薪資待遇，相關社會保險及公積金按照深圳市有關規(guī)定執(zhí)行。
2. 符合條件的可選擇落戶深圳市，并且享受深圳市人才生活和租房補貼，具體金額以政府最新規(guī)定為準。
3. 提供良好的工作環(huán)境和充足的研究經(jīng)費，配備精良的實驗儀器，科研方向給予較高自由度。
4. 提供良好的科研環(huán)境和深造學習培訓的機會，表現(xiàn)優(yōu)異可協(xié)助推薦到國內外知名科研單位深造學習和開展科研合作。
五、申請方式
申請者請將個人簡歷（包含教育經(jīng)歷、研究經(jīng)歷、論文發(fā)表）、代表作和工作規(guī)劃以電子郵件形式發(fā)送至：chengshifeng@caas.cn【快捷投遞：點擊下方“立即投遞/投遞簡歷”，即刻進行職位報名】。郵件主題和材料壓縮文件請注明“姓名+申請職位名稱+高校人才網(wǎng)”。
所有應聘材料我們將會嚴格保密，課題組會在收到申請的一個月內與初審合格者電話或E-mail聯(lián)系，安排面試。資格審查未通過者，不再另行告知。
課題組負責人程時鋒老師代表性論文
*第一作者 ?通訊作者
1. Cheng S*, Wong G, Melkonian M. Giant DNA viruses make big strides in eukaryote evolution. Cell Host & Microbe (2021). https://doi.org/10.1016/j.chom.2021.01.008
2. Cheng S*, Xian W, Fu Y, et al. Genomes of Subaerial Zygnematophyceae Provide Insights into Land Plant Evolution. Cell, 2019, 179(5): 1057-1067. e14.
3. Griesmann M, Chang Y, Liu X, et al. Cheng S?. Phylogenomics reveals multiple losses of nitrogen-fixing root nodule symbiosis. Science, 2018, 361(6398): eaat1743.
4. Cheng S*, Melkonian M, Smith SA, et al. 10KP: A phylodiverse genome sequencing plan. Gigascience. 2018;7(3):1–9.
5. Cheng S*, Gutmann B, Zhong X, et al. Redefining the structural motifs that determine RNA binding and RNA editing by pentatricopeptide repeat proteins in land plants. Plant J. 2016;85(4):532–547.
6. Lin S, Cheng S*, Song B, et al. The Symbiodinium kawagutii genome illuminates dinoflagellate gene expression and coral symbiosis. Science. 2015;350(6261):691–694.
7. Cheng S*, van den Bergh E, Zeng P, et al. The Tarenaya hassleriana genome provides insight into reproductive trait and genome evolution of crucifers. Plant Cell. 2013;25(8):2813–2830.
8. Zhang, G., Liu, X., Quan, Z. Cheng S*. et al. Genome sequence of foxtail millet (Setaria italica) provides insights into grass evolution and biofuel potential. Nat Biotechnol 30, 549–554 (2012).
